Biológiai minták, elsősorban különböző testfolyadékokban található fehérjék, illetve azok poszt-transzlációs módosításainak (glikoziláció) műszeres analitikai vizsgálata. A glikoziláció egy alapvető kémiai módosítása a fehérjéknek, ami fontos szerepet játszik azok fizikai, kémiai és funkcionális tulajdonságaiban. A glikánok struktúrális heterogenitása a glikozidázok és glikozil-transzferázok expressziós szintjének függvénye, ami különböző patológiás körülmények között változhat. A glikozilációs változások érzékeny indikátorai lehetnek a sejtekben zajló biokémiai folyamatoknak, ezáltal a glikoziláció analízis egy új utat nyithat a biomarker kutatás területén. Hatékony szénhidrát-specifikus markerek segítségével a különböző betegségek korábban felismerhetőek lehetnek, megóvva ezzel a pácienseket a sokszor komplikált és időigényes diagnosztikai eljárásoktól. Ez különösen olyan elváltozások esetében kritikus melyeknél nem áll rendelkezésre konkrét diagnosztikus marker a betegség azonosítására.
A fehérjéken levő glikánokat egy enzimatikus kezelés révén elválasztjuk a fehérjéktől majd fluoreszcensen derivatizáljuk lehetővé téve ezzel nagyon kis mintamennyiségek detektálását (<1µg). Az analízist egy nagy felbontású és áteresztőképességű ultra-magas nyomású folyadéékkromatográffal végezzük kombinálva fluoreszcens és tömegspektrométeres detektálással. A leírt eljárás ugyanakkor nem csupán klinikai minták vizsgálatára alkalmas hanem a biológiai terápiák során alkalmazott monoklonális antitestek glikozilációs profilozására is.
A KOMPETENCIÁBA TARTOZIK
- Hidrofil-interakciós folyadékkromatográfia
- Ioncserés kromatográfia
- Méretkizárásos kromatográfia
- Reverz-fázisú kromatográfia
- Fehérjék aminosav öszetételének meghatározása
- Monoszacharid analízis
- Fehérje aggregátumok vizsgálata
SZOLGÁLTATÁSOK
- Adott mintában levő cukorszerkezetek meghatározása
- Monoszacharid összetétel meghatározása
- Betegségspecifikus elváltozások detektálása
- Fehérjemódosulások kimutatása
ESZKÖZÖK
- Waters UPLC-MS
- Empower Chromatography Software
- Glykoworkbench
- Peptidemass